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如何用C代碼給Python寫擴展庫(Cython)

系統 1993 0

之前一篇文章里提到了利用Cython來編譯Python,這次來講一下如何用Cython給Python寫擴展庫。

兩種語言混合編程,其中最重要的是類型的傳遞。

我們用一個簡單的例子進行入門:這次的目標是用C語言寫一個Numpy的加法和元素相乘模塊。在本例中,Numpy的array被傳入到C語言模塊內,變成了二維數組。

1. 頭文件main.h:

            
#ifndef _MAIN_H
#define _MAIN_H
void plus(double *a, double *b, double *r, int n, int m); // 矩陣加法
void mul(double *a, double *b, double *r, int n, int m); // 矩陣按元素相乘
void main(double *a, double *b, double *r, int n, int m, int times); // 用于測試的main函數
#endif
          

2.? 把主要代碼寫在main.c中:

            
#include "main.h"
 
/***********************************
* 矩陣的加法
* 利用數組是順序存儲的特性, *
* 通過降維來訪問二維數組! *
* r
***********************************/
void plus(double *a, double *b, double *r, int n, int m)
{
  int i, j;
  for(i = 0; i < n; i++)
  {
    for(j = 0; j < m; j++)
      *(r + i*m + j) = *(a + i*m + j) + *(b + i*m + j);
  }
}
 
/***********************************
* 矩陣的按元素乘法
* 利用數組是順序存儲的特性, *
* 通過降維來訪問二維數組! *
* r
***********************************/
void mul(double *a, double *b, double *r, int n, int m)
{
  int i, j;
  for(i = 0; i < n; i++)
  {
    for(j = 0; j < m; j++)
      *(r + i*m + j) = *(a + i*m + j) * *(b + i*m + j);
  }
}
 
/***********************************
* main函數
* 利用數組是順序存儲的特性, *
* 通過降維來訪問二維數組! *
* r
***********************************/
void main(double *a, double *b, double *r, int n, int m, int times)
{
  int i;
  // 循環times次
#pragma omp parallel for
  for (i = 0; i < times; i++)
  {
    // 矩陣的加法
    plus(a, b, r, n, m);
    
    // 矩陣按元素相乘
    mul(a, b, r, n, m);
  }
}

          

這個main.c中實現了矩陣的加法、矩陣按元素相乘的功能,用到的數據結構是二維數組,但是因為C語言中給函數傳遞二維數組比較麻煩,這里用降維的方法實現。另外在main()函數中,采用一個循環來進行測試,以測試性能。

3. 下面編寫test.pyx文件來調用上述C函數(注意,后綴是.pyx噢):詳細的知識點在注釋中寫出來了~

            
# 既要import numpy, 也要用cimport numpy
import time
import numpy as np
cimport numpy as np
 
# 使用Numpy-C-API
np.import_array()
 
# cdefine C 函數
cdef extern from "main.h":
  void plus(double *a, double *b, double *r, int n, int m)
  void mul(double *a, double *b, double *r, int n, int m)
  void main(double *a, double *b, double *r, int n, int m, int times)
 
"""
# 定義一個"包裝函數", 用于調用C語言的main函數,調用范例:plus_fun(a, b, r)
# 在這里要注意函數傳入的參數的類型聲明,double表示數組的元素是double類型的,
# ndim = 2表示數組的維度是2
# 在調用main函數時,要把python的變量強制轉化成相應的類型(以確保無誤),比如
            
              
# 當然,基本類型如int,可以不顯式地寫出來,如下面的a.shape[0]、a.shape[1]
"""
def main_func(np.ndarray[double, ndim=2, mode="c"] a not None,
           np.ndarray[double, ndim=2, mode="c"] b not None, 
           np.ndarray[double, ndim=2, mode="c"] r not None,
           times not None):
  main(
              
                 np.PyArray_DATA(a),
        
                
                   np.PyArray_DATA(b),
        
                  
                     np.PyArray_DATA(r),
        a.shape[0],
        a.shape[1],
        
                    
                       times)

                    
                  
                
              
            
          

4. 為了用Cython編譯上述代碼,我們創建一個setup.py文件:

            
import numpy
from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Distutils import build_ext
 
filename = 'test' # 源文件名
full_filename = 'test.pyx' # 包含后綴的源文件名
 
setup(
  name = 'test',
  cmdclass = {'build_ext': build_ext},
  ext_modules=[Extension(filename,sources=[full_filename, "main.c"],
         include_dirs=[numpy.get_include()])],
)


          

5. 上述的main.h、main.c、test.pyx一定要放在同一個文件夾下。此時在該文件夾下按住shift鍵,然后右擊鼠標,打開cmd或PowerShell控制臺,在控制臺中運行以下命令進行Cython編譯:

python setup.py build_ext --i

或者:

python setup.py build_ext --inplace

編譯成功的圖例:

如何用C代碼給Python寫擴展庫(Cython)_第1張圖片

此時在同目錄下會生成“test.cp36-win_amd64.pyd”的二進制碼文件,它是閉源的,但是可以直接用python來import。下面編寫測試代碼main.py來進行測試:

            
import test
import time
import numpy as np
 
start_time = time.time()
a = np.random.rand(100, 100) * 2 - 1 # 生成300*300的隨即矩陣
b = np.random.rand(100, 100) * 2 - 1
r = np.empty_like(a) # 創建一個空矩陣,用來存儲計算結果
test.main_func(a, b, r, 500000) # 調用main_func進行測試
end_time = time.time()
print(end_time - start_time) # 輸出時間
print(r) # 輸出運行結果

          

執行結果:

如何用C代碼給Python寫擴展庫(Cython)_第2張圖片

通過本例我們可以看到:將循環放在C語言模塊中,而不是原生的Python中,可以提高執行效率。

以上就是本文的全部內容,希望對大家的學習有所幫助,也希望大家多多支持腳本之家。


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